Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1024Q9UPX6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms