Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
L1RE1Q9UN81 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms