Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms