Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms