Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms