Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA2Q9UL42 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms