Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CROTQ9UKG9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms