Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNIKQ9UKE5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms