Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms