Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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