Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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