Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms