Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms