Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A2Q9NTI2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms