Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms