Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms