Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms