Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms