Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FOXQ1Q9C009 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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