Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms