Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms