Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC22CQ9BRL7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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