Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms