Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms