Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms