Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms