Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms