Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms