Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms