Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCGB3A2Q96PL1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms