Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPNS2Q96L46 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms