Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms