Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms