Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms