Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms