Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms