Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms