Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms