Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms