Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms