Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms