Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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PTPRUQ92729 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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PTPRUQ92729 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
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PTPRUQ92729 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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PTPRUQ92729 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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PTPRUQ92729 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
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