Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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