Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC191Q8NCU4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms