Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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