Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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