Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CLDN19Q8N6F1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN19Q8N6F1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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