Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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