Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms