Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9AQ7Z3C6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG9AQ7Z3C6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms